在神經(jīng)科學研究中,尤其是在體實驗,通常利用腺相關(guān)病毒(AAV)工具載體研究基因在神經(jīng)系統(tǒng)中的功能作用,原因在于相較于其他基因運載工具,AAV病毒具有免疫原性低、安全性好并能實現(xiàn)基因的長效表達等優(yōu)點。
AAV載體的選擇
腺相關(guān)病毒為單鏈DNA病毒(ssAAV), 在入核、脫衣殼后,需要借助宿主DNA聚合酶或者分子間退火完成雙鏈轉(zhuǎn)化,才能啟動基因轉(zhuǎn)錄過程,這一過程限制了AAV載體介導(dǎo)的基因轉(zhuǎn)導(dǎo),并直接影響病毒的感染效率。自身互補雙鏈 DNA 的腺相關(guān)病毒(scAAV)能夠克服這一限制,不需要經(jīng)歷一個由單鏈變?yōu)殡p鏈的過程,也就是說,雙鏈AAV病毒進入細胞后,可以直接表達,并且表達時間更快,表達水平更高。因此,在神經(jīng)研究中,您也可以根據(jù)需要選擇scAAV載體,完成目的基因更快表達,或者基因更強表達的研究。
ssAAV & scAAV
啟動子的選擇
根據(jù)啟動子的表達特征,我們通常將啟動子分為組成型啟動子、誘導(dǎo)型啟動子以及器官/組織特異性啟動子,這些啟動子各具特色。神經(jīng)系統(tǒng)的組成及其復(fù)雜,腦部的精密研究非常關(guān)鍵。要想實現(xiàn)某個腦區(qū)甚至是某一類細胞特異性感染,選擇一種特異性相對更強的啟動子尤為重要。
①組成型啟動子
一般來自于管家基因,可連續(xù)不斷地啟動基因的表達。如巨細胞病毒啟動子CMV、CMV增強子融合的雞?-肌動蛋白啟動子CAG或泛素C啟動子UBC等等。
②誘導(dǎo)型啟動子
只有在一定的外界誘導(dǎo)或刺激作用下才能啟動基因的表達,如四環(huán)素啟動子TRE。
③器官/組織特異性啟動子
只有在特定的器官/組織中才能啟動基因的表達,下圖為大家列出的是一些常見的神經(jīng)組織特異性啟動子:
轉(zhuǎn)錄后調(diào)控元件的添加
除了啟動子外,AAV載體上其他元件的使用與優(yōu)化也非常關(guān)鍵,尤其是轉(zhuǎn)錄后調(diào)控元件的添加,對于mRNA的剪接及核輸出、mRNA的穩(wěn)定性及翻譯等具有重要意義,下面列舉兩個對于提高外源基因表達非常重要的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控元件。
① 內(nèi)含子
真核mRNA內(nèi)含子在真核生物基因表達調(diào)控中起著重要的作用,是轉(zhuǎn)基因研究中提高外源基因表達的重要元件之一。在多數(shù)情況下,真核mRNA內(nèi)含子的存在可以提高基因的表達水平,因為其剪接過程會影響mRNA新陳代謝的多個階段,包括轉(zhuǎn)錄、RNA編輯、pre-mRNA的加工、mRNA的出核運輸、翻譯等。所以說,在載體容量允許的情況下可添加一個內(nèi)含子,有助于刺激基因的表達。
② WPRE元件
土撥鼠肝炎病毒轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié)序列WPRE是一段順式作用的RNA元件,放在多聚腺苷酸化信號之前可顯著增加mRNA的表達水平和翻譯效率,進而增強基因的表達,并且WPRE插入病毒載體中還可以大大提升病毒包裝的滴度。然而由于WPRE序列較長(600bp左右),所以還需要視具體的載體容量選擇性插入。
AAV注射方式的選擇
目前AAV在神經(jīng)系統(tǒng)研究中的注射方法主要有3種:腦定位注射、靜脈注射和腦脊液注射,每種注射方式各有優(yōu)缺點,研究者可根據(jù)具體的研究對象以及實驗方案,選擇適合的注射方式,推薦進行預(yù)實驗對實驗
效果做初步測試,以得到更優(yōu)的選擇方案。
值得注意的是,除了以上所述各項因素外,AAV病毒本身的滴度和純度,目的基因本身的自然屬性(如胞內(nèi)蛋白/分泌蛋白/轉(zhuǎn)運蛋白)以及AAV感染后所使用的檢測方法等因素也會影響到基因最終的表達效果。因此,在神經(jīng)系統(tǒng)研究中,想要驅(qū)動更高效的基因轉(zhuǎn)導(dǎo),可以綜合考慮以上各項因素,優(yōu)化選擇。