環(huán)狀RNA（CircRNA）
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環(huán)狀RNA(circular RNA,circRNA)是一類特殊的非編碼RNA分子，與傳統(tǒng)的線性RNA(linear RNA)不同，它是通過(guò)反向剪接形成的閉合RNA分子。circRNA不具有5'末端帽子和3'末端poly(A)尾巴，通過(guò)外顯子環(huán)化或內(nèi)含子環(huán)化，將3'和5'末端連接起來(lái)形成完整的環(huán)形結(jié)構(gòu)，避免被核酸外切酶降解，因而比線性RNA更穩(wěn)定，更具有保守性。環(huán)狀RNA在疾病中起著關(guān)鍵作用，特別是在癌癥中，在疾病診斷和治療策略開發(fā)上有獨(dú)特優(yōu)勢(shì)。
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CircRNA發(fā)現(xiàn)歷程表
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環(huán)狀RNA生成:
A. 經(jīng)典的線性RNA剪切方式： 通過(guò)內(nèi)含子中的GU/AG序列，將前后外顯子首尾相連,成熟的RNA都具有5’短帽子結(jié)構(gòu)和3’PolyA尾巴；
B. 環(huán)狀RNA的剪切方式： 通過(guò)特異性反向剪切，后面外顯子的尾端與前面外顯子的前端相連，沒有5’短帽子結(jié)構(gòu)和3’PolyA尾巴，由一個(gè)或者多個(gè)外顯子構(gòu)成, 有些環(huán)狀RNA也包含內(nèi)含子。
環(huán)狀RNA的特點(diǎn):
1. 具有閉合環(huán)狀結(jié)構(gòu)，半衰期較線性RNA長(zhǎng)；
2. 具有特異的反向剪接位點(diǎn)（backsplice）；
3. 具有組織表達(dá)特異性、疾病特異性等；
4. 大多存在于胞質(zhì)(CiRNA、EIciRNA)中，少部分存在于胞核中；
5. 大部分為非編碼RNA，且序列高度保守；
6. 整體表達(dá)豐度低于mRNA；
環(huán)狀RNA的分類:
根據(jù)circRNA序列來(lái)源,可以把circRNA分為四類:
第一種是全部來(lái)源于母基因外顯子的circRNA(Exonic circRNA,EciRNA)；
第二種是全部來(lái)源于內(nèi)含子的套索型circRNA(Circular intronic RNA,ciRNA）；
第三種是來(lái)源于外顯子和內(nèi)含子的circRNA(Exon-intron circRNA,EIciRNA)；
第四種包括來(lái)源于反義鏈轉(zhuǎn)錄本的反義circRNA (Antisense circular RNA) 、來(lái)源于基因間序列或其他未注釋基因組序列的circRNA (Intergenic circular ）。
絕大多數(shù)的circRNA屬于外顯子類型的circRNA，保守性較其他種類的circRNA也更高。
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CircRNA發(fā)現(xiàn)歷程表
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環(huán)狀RNA主要生物學(xué)功能:
1.miRNA海綿功能
根據(jù)堿基的互補(bǔ)配對(duì)法則,miRNA通過(guò)與靶基因中非翻譯區(qū)域結(jié)合從而抑制或促進(jìn)mRNA的翻譯。RNA之間可以通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)的方式結(jié)合共同的miRNA來(lái)影響miRNA對(duì)靶基因的抑制作用,這一類RNA稱為競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)。研究表明，circRNA結(jié)構(gòu)穩(wěn)定且含有大量的miRNA應(yīng)答原件，可以作為高效的ceRNA，與miRNA結(jié)合，發(fā)揮miRNA海綿功能，吸附miRNA，有效地抑制miRNA與靶基因非翻譯區(qū)的結(jié)合，從而實(shí)現(xiàn)對(duì)靶基因的調(diào)控作用。另外，有些circRNA還可以與多個(gè)miRNA結(jié)合,影響多種基因的調(diào)控。
2.作為翻譯模板
circRNA缺乏帽依賴性翻譯的必需元件，如5'帽和polyA尾，因此，一般情況下被認(rèn)為不具備翻譯的功能。但是近年來(lái)隨著對(duì)circRNA的進(jìn)一步的研究,發(fā)現(xiàn)有少數(shù)的circRNA含有內(nèi)部核糖體進(jìn)入位點(diǎn)序列（IRES）使其具備了翻譯能力，比如circ-ZNF609,circMb1,circFBXW7,circPINTexon2和circ-SHPRH已被證實(shí)可作為蛋白質(zhì)模板。
3.調(diào)控基因表達(dá)
有些CircRNA可與轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合調(diào)控基因的轉(zhuǎn)錄。EciRNA可以與細(xì)胞內(nèi)某些蛋白質(zhì)分子特異性結(jié)合, 作為腳手架 (Scaffold) 與RNA或DNA結(jié)合, 為RNA結(jié)合蛋白（RBP）、RNA、DNA之間互作提供平臺(tái)。
CircRNA數(shù)據(jù)庫(kù):
① circBase（http://www.circbase.org/）
circBase收集了近幾年研究發(fā)現(xiàn)的上萬(wàn)種環(huán)狀RNA，是一個(gè)通過(guò)收集和整合已經(jīng)發(fā)布的circRNA數(shù)據(jù)構(gòu)建的數(shù)據(jù)庫(kù)。目前該數(shù)據(jù)庫(kù)收集包括以下7個(gè)物種的circRNA信息：人(hg19)、小鼠(mm9) 、秀麗線蟲(ce6)、黑腹果蠅(dm3)、矛尾魚(latCha1)、腔棘魚(latCha1)、真渦蟲（S.mediterranea），通過(guò)在搜索界面中的list search提交circBase支持的circRNA ID號(hào)或基因組區(qū)域位置信息，可以快速查詢相關(guān)circRNA信息；研究者也可以通過(guò)table browser進(jìn)行條件設(shè)置，篩選自己所需要的circRNA數(shù)據(jù)。
② circRNABase數(shù)據(jù)庫(kù)
（http://starbase.sysu.edu.cn/starbase2/mirCircRNA.php）
該數(shù)據(jù)庫(kù)通過(guò)整合已發(fā)表的circRNA數(shù)據(jù)，構(gòu)建miRNA與circRNA以及circRNA與RNA結(jié)合蛋白（RBP)的互作網(wǎng)絡(luò)。
維真CircRNA服務(wù)項(xiàng)目:
① CircRNA載體構(gòu)建與病毒包裝
維真生物將環(huán)化框裝入載體中，構(gòu)建成功了大量circRNA表達(dá)載體，并建立了腺病毒、慢病毒和AAV全套circRNA過(guò)表達(dá)和干擾載體的系統(tǒng)。
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部分載體列表：
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更多環(huán)化載體咨詢，請(qǐng)撥打400-077-2566，或當(dāng)?shù)劁N售經(jīng)理。
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② CircRNA表達(dá)量與成環(huán)性檢測(cè)
維真生物可提供專業(yè)的circRNA表達(dá)量與成環(huán)性檢測(cè)服務(wù)。我們能針對(duì)CircRNA上的不同區(qū)域設(shè)計(jì)特異性的RT-PCR驗(yàn)證引物，從而檢測(cè)circRNA的表達(dá)水平，并能準(zhǔn)確的計(jì)算成環(huán)效率。
